Боборыкин, Яков Михайлович, сын Михаила Борисовича, дворянин, помещик новгородский, ум. в 1631 г. В 1613 г. он ездил в Выборг для переговоров об избрании шведского королевича на московский престол, но когда в Москве воцарился Михаил Феодорович, Боборыкин отказался от прежних замыслов и принял участие в посольстве, отправленном новгородскими лучшими людьми в Москву. Так как Новгород был еще занят шведами, с Горном во главе, то посольство выставляло своей целью напомнить московским боярам о их намерении избрать в цари королевича, но на самом деле послы должны были бить челом Михаилу о винах и просить помощи против Горна. Царь допустил послов к своей особе и дал им две грамоты: явную, в которой сурово осуждал новгородцев за их измену, и тайную, в которой отпускал им все вины и обещал помощь против шведов. Но думный дьяк Петр Третьяков выдал Горну тайну, и шведский воевода сурово наказал всех участников посольства. В 1617—19 гг. Боборыкин был воеводой в Старой Руссе, в 1621 г. дозирал Вагу и составлял сотные грамоты, с 1622 г. заседал в Поместном приказе, сначала в товарищах кн. Сицкого, а в 1628—31 гг. сам управлял этим приказом. Кроме того, в 1624—29 гг. он постоянно нес различные службы при государеве дворе, между прочим в 1626 г. участвовал в свадебных торжествах царя Михаила с Евдокией Стрешневой.
Дворцовые Разряды, I, 288, 342, 415, 512, 616, 645, 687, 758—759, 761—762, 776, 790, 800, 802, 829, 832, 870, 875, 877, 904, 906, 909, 914 (по ошибке назван Ивановичем), 930, 954, 957, 969, 982, 999, 1002, 1005, 1009, 1024, 1029—1030; II, 2, 13, 21, 24, 41, 45, 55, 58—59, 69, 83, 85, 812. — Разрядные книги. — Бархатная книга. — Древняя Российская Вивлиофика, XIII, 160. — Русск. Истор. Библиот., V, IX, VIII, XIV, XV. — Акты Археограф. Экспедиции. — Соловьев, «История России». — Словарь Березина.