Господствующая вѣра въ Онежскомъ уѣздѣ христіанская православнаго исповѣданія. Другихъ исповѣданій нѣтъ, кромѣ раскольниковъ, не принимающихъ священства, но поклоняющихся иконамъ. Число ихъ простиралось въ 1851 году до 148 душъ, въ томъ числѣ мущинъ 56, женщинъ 92. Слѣдственно и здѣсь, какъ и вообще по губерніи, раскола придерживается болѣе женскій полъ, какъ менѣе образованный и болѣе довѣрчивый мущинъ.
Въ Онежскомъ уѣздѣ считается вообще 63 церкви, въ томъ числѣ: а) каменныхъ 12, деревянныхъ 51, часовенъ деревянныхъ 56, приходовъ 30.
Въ этомъ уѣздѣ, на островѣ Кіѣ, лежащемъ на Онежской губѣ, въ 15 верстахъ отъ города Онеги, находится второклассный Крестный монастырь, построенный въ 1657 году Святѣйшимъ Никономъ Патріархомъ Московскимъ и всея Россіи. Въ этомъ монастырѣ три каменныхъ церкви и одна деревянная внѣ онаго. Главную его драгоцѣнность, составляетъ устроенный въ Палестинѣ изъ кипариса чудотворный Крестъ по точному размѣру Креста Христова. Крестъ этотъ украшенъ по краямъ серебрянымъ позолоченнымъ окладомъ, и въ немъ вложены части святынь, между коими части Крови Господней, камня отъ Гроба Господня, самаго древа Креста Господня и Ризы Господней; части чудотворныхъ мощей Угодниковъ Божіихъ по всей лицевой сторонѣ его и по внутренней, обращенной къ стѣнѣ иконостаса, въ серебропозлащенныхъ
